Sendo um órgão integrante do Sistema Nacional de Saúde, tem por finalidade o estudo, o planejamento, a execução e o controle dos assuntos relativos à saúde pública no Estado do Amazonas, competindo-lhe especialmente:

I- Avaliar os níveis de saúde da população;
II- Formular a Política Estadual de Saúde, observadas as diretrizes nacionais do setor;
III- Elaborar e executar programas integrados de Saúde;
IV- Elaborar, executar e ou coordenar a execução de Planos, Programas de Assistência médico-sanitária e hospitalar à população;
V- Coordenar todas as ações de saúde desenvolvidas no Estado pelas entidades Federais, Estaduais, Municipais e Autárquicas, de caráter público e particular;
VI- Coordenar,supervisionar e executar as ações de vigilância epidemiológica no Estado;
VII- Coordenar supervisionar ou executar as ações relacionadas com o sistema de Informações de Saúde;
VIII- Estabelecer normas técnico-científicas relativas às ações de promoção, proteção e recuperação de Saúde e fiscalizar seu cumprimento;
IX- Assistir técnica e financeiramente os Municípios visando a implantação e operação dos serviços básicos de saúde à população local.

Lei nº12 de 09/05/1952, publicado em Diário Oficial de 09/05/1953.
Criação da Secretária de Educação, Cultura e Saúde.

Lei nº108 de 23/12/1955,
Desmembra a Saúde da Educação e cria a Secretária de Assistência e Saúde - SAS.

Lei nº1336 de 13/07/1979,
Cria a Secretaria de Estado de Saúde - SESAU.

ESTRUTURAÇÃO

Com o processo de mudanças das ações de Saúde, acompanhadas pelos preceitos federais, a Secretaria de Estado da Saúde, foi se adequando dentro da realidade do Estado, passando assim por vários processos de reestruturação do seu organograma a partir de 1955.
Os anos de reorganização estrutural da Sesau foram: 1955 / 1965 / 1967 / 1971 / 1981 / 1984 / 1990 / 1991.

EX-SECRETÁRIOS DE ESTADO DA SAÚDE

Secretário: Dr. Edson Stanislau Affonso
Período: 05.01.1956 à 01.08.1956

Secretário: Dr. Jorge Alberto Mendes
Período: 01.08.1956 à 09.04.1958

Secretário: Dr. José Joaquim de Souza Contente
Período: 09.04.1958 à 31.01.1959

Secretário: Dr. Nilson Vasconcelos
Período: 02.02.1959 à 30.01.1963

Secretário: Dr. Akel Nicolau Akel
Período: 31.01.1963 à 14.05.1964

Secretário: Dr. José Francisco da Gama e Silva
Período: 18.05.1964 à 30.06.1964

Secretário: Dr. Theomário Pinto da Costa
Período: 30.06.1964 à 26.11.1965

Secretário: Dr.Alberto Carreira da Silva
Período: 27.11.1965 à 31.01.1967

Secretário: Dr. José Leite Saraiva
Período: 31.01.1967 à 12.03.1971

Secretário: Dr. Antônio Ricci
Período: 15.03.1971 à 15.031975

Secretário: Dr. Carlos Augusto T. de Borborema
Período: 15.03.1975 à 15.03.1979

Secretário: Dr. Francisco de Paula Castro Neto.
Período: 15.03.1979 à 24.02.1981

Secretário: Dr. Tancredo Castro Soares
Período: 24.02.1981 à 13.03.1983

Secretário: Dr. Nelson Antunes de Araújo Filho
Período: 15.03.1983 à 28.06.1984

Secretário: Dr. Euler Esteves Ribeiro
Período: 29.06.1984 à 13.03.1987

Secretário: Dr. Gilson dos Santos Moreira
Período: 16.03.1987 à 15.05.1987

Secretário: Dr. Humberto Figlioulo
Período: 06.05.1987 à 15.10.1987

Secretário: Dr. Euler Esteves Ribeiro
Período: 15.10.1987 à 29.08.1988

Secretário: Dr. Luiz Fernando Sarmento Nicolau
Período: 29.08.1988 à 16.03.1989

Comissão Administrativa da SESAU - Dec. Nº11879 de 16.03.1989
Período: 16.03.1989 à 23.05.1989

Secretário: Dr.Tancredo Castro Soares
Período: 23.05.1989 à 02.04.1990

Secretário: Dr. Carlos Augusto Teles de Borborema
Período: 02.04.1990 à 14.03.1991

Secretário: Dr. Arnaldo Russo
Período: 15.03.1991 à 30.06.1992

Secretário: Dr. Aberlado Rodolfo Lemos Pampolha
Período: 30.06.1992 à 18.04.1994

Secretário: Dr. Henrique de Oliveira Melo
Período: 18.04.1994 à 27.12.1994

Secretário: Dr. Francisco Garcia Rodrigues
Período: 01.01.1995 à 04.05.1995

Superintendente: Dr. Manuel Jesus Pinheiro Coelho
Período: 31.05.1995 à 11.10.1995

Superintendente: Dr. Alfredo Pereira do Nascimento
Período: 11.10.1995 à 29.05.1996

Superintendente: Dr. Paulo Nasser
Período: 09.07.1996 à 17.10.1996

Superintendente: Dr. Risonildo Carneiro de Almeida
Período: 17.10.1996 à 09.12.1996

Superintendente: Dr. Laerte Carlos Maués
Período: 09.12.1996 à 05.05.1997

Superintendente: Dr. Tancredo Castro Soares
Período: 05.05.1997 à 21.07.1999

Secretário: Dr. Francisco Deodato Guimarães
Período: 12.08.1999 à 31.12.2000

Secretário: Dr. Francisco Deodato Guimarães
Período: 16.01.2001 à 31.12.2002

Secretária: Dra. Leny Nascimento da Motta Passos
Período: 01.01.2003 à 17.11.2004

Secretária: Dr. Wilson Duarte Alecrim
Período: 18.11.2004 até os dias atuais.